予約不要

まずプラハ→チェスキークロムノフは直通はなくてチェスキーブデヨブィッツエ乗り換えです。
チェスキーブデヨブィッツエから先はローカル線のようなディーゼルカーで2等車しかありません。当然自由席です。
プラハ→チェスキーブデヨブィッツエは幹線ですが、チェコの列車は国際列車や一部の特急以外は基本的に自由席ですので、あらかじめ日本から予約して切符を買う必要はまったくありません。
まず全席指定という列車はないです。
日本から予約するととんでもない手数料を取られるし、たぶん予約・発券は不可能なはずです。
チェスキーブデヨブィッツェからの国際バスも予約は不要です。４月末はヨーロッパはただの平日ですから夏のように学生旅行者で混み合うこともありません。