私ならAA(アメリカン航空)です

UAは大雑把、AAはテキパキ(フットワークが良い)で中南米便には強く便数も多いです。

>乗り継ぎの時間が二時間足らずで、間に合うのかとても心配です。
予約が出来ると言うことは基本的に問題ないと言う事でもあります。

>万一、予約していた飛行機に乗り遅れてしまった場合は、
>現地でさらに料金を支払って、別のチケットをとることに
>なるのでしょうか?

貴方の責任以外の場合には航空会社が対応してくれますがクレームを付けないと放って於かれます。
アナウンスを注意して聞きましょう。