松本行夜行バスはある

手元の春の時刻表には上高地行はなかった（夏季限定運行かも知れないので夏はあるかも）ですが、松本行はあるので、もし上高地行がなくても松本から上高地までパスでプラン１（修正）でOKかと。

旅は手前から攻める（観光する）のが定石ですが、夜行がある場合は遠くからが定石となります。
初日の上高地が朝から観光できるからです。郡上八幡先行の場合は初日の観光が午後からになります。

＞そうすると高山から次、上高地、白川郷と方向が違うので、どうプラン立てたら良いかわからなくなりました

これはないですよ。逆に回ればいいのですから。
郡上、白川郷、高山、上高地と。
でもそうすると、郡上、高山泊となり、上高地が厳しいかと。1，2時間の散策として、バスで出た松本から特急＋新幹線なら深夜自宅着が可能かも知れませんが、バスだと無理では？

上高地も行きたいなら、夜行バスで上高地（なければ松本）でしょう。