出港の45分位前にチェックインしなければいけないはずです。

Sandip さん、はじめまして！

昨夏、ヘルシンキ〜タリンを往復しました。

乗ったのは『タリンク シリア ライン』ですが、出港の45分位前にチェックインをしなければなりません。
それに日本では考えられませんが、私たちの時は予定時刻より早めに出港しました。
フェリー乗り場って結構広くて、チェックインからかなり歩かなければなりませんし、ヘルシンキ〜タリンは、観光客だけでなく地元の人も買い出し等で利用する為結構混み合いますので、できるだけ早めに乗船して、いい場所を確保した方がいいですよ。

因みに私は、イギリスの『Direct Ferries』のサイトで、幾つかのフェリー会社を比較して決めました。
出港時刻、所要時間、フェリーの種類によっても料金が違います。
また、タリン行きのフェリーの港は2箇所あるので、間違えないように気をつけてくださいね。

いずれにしても、慣れない海外での入国、移動（バス、トラム、フェリー）は、時間の余裕がないと、難しいと思います。