MCT http://www.airchina.co.jp/timetablejp/serviceguide.pdf の国航サイトの7ページ(P12)で案内しているように、MCTは60分(スルーチェックインサービスを受けた場合)です。 お示しになったサイトのニュースは第2ターミナルのことです。国航は第3ターミナル使用ですから、関係ありません。 CA980の運行実績のサイトをお示しのことは確かに参考になりますが。
ありがたいご指摘ではありますが、情報収集が甘かったですね! 質問者の書き込みから判断できるのは、バンコクからエアチャイナで帰国して、北京での乗り継ぎ時間が110分ということだけです。この条件だと、バンコク→北京はCA980便6時30分着だと限定できます。 そこから110分の乗継で帰国するということは、北京→那覇CA831便 8時20分発で特定できます。あなたが示されたhttp://www.airchina.co.jp/timetablejp/serviceguide.pdfで確認をしますと、那覇空港はスルーチェックインの対象外となっていますね。