1泊なら

「もしくは1泊」というところを読み飛ばしていました。失礼しました。

1泊なら、西・南・東ボヘミア、モラヴィア、シレジアにも足を運べます。地方都市や小さな町に泊まって、プラハとは全く異なるのどかなチェコの田舎の景色を眺めながら旅をするのは新鮮な発見だと思います。

他の回答者の方々の挙げられた場所に加え、マリアーンスケー・ラーズニェ（カルロヴィ・ヴァリのずっと南）、4月以降ならリトミシュル（プラハとオロモウツを結ぶ直線の途中の位置。11-3月：城は休館）やクロムニェジーシュ城・レドニツェ城・ヴァルティツェ城（ブルノに1泊して拠点にすると良いと思います。11-3月は休館）あたりも範囲に入ると思います。
個人的には、プラハと違う雰囲気でまださほど観光客ずれしていないテルチ、ターボル、フルボカー（城）あたりがお口直しに良いのではないかと思います。

温泉町は、温泉自体は本来治療目的なので長期滞在が前提なのですが、カルロヴィ・ヴァリやマリアーンスケー・ラーズニェあたりだとその辺の感覚が曖昧で、観光地であるためプラハ発1泊ツアーもあるようです。町の豪華な建築物を眺めて回るだけでも十分楽しめると思います。

改めて、楽しいご旅行を。