比較は普通運賃とが適切かも

＞3日分のパスと、3回分の早割料金と比較してみます。

どの列車にも乗れ、払い戻しもできるパスと条件が同じなのは早割でなく、普通運賃です。
それと比較して、普通運賃のほうがパスの７～９割程度と安い場合でも、窓口に並ぶ必要のないパスを選ぶ方もいるようです。
このトピでパスを勧める方が多いのは下記の利便性にあると思います。

ジャーマンレイルパスとバイエルンチケットも単純に値段では比較できません。
前者は７時、８時台のICEやICの乗れますが、後者は快速REと普通RBだけ。しかも平日は９時以降の列車しか乗れません。
このため、ミュンヘンからローテンブルクへは前者はICでヴュルツブルク経由で約２時間、後者はトロイヒトリンゲン経由で約３時間（乗り換え時間入れず）と１時間も前者の方が速いです。前者が８時発１０時着か７時発９時着なら後者は９時発１２時着となり、到着時刻が２時間か３時間も遅くなります。時間の限られた方には致命的差です。
一般論として、日本を１週間程度で回る外国人は快速、普通しか乗れない青春１８きっぷでなく、新幹線、特急にも乗れるジャパンレイルパスを買います。
青春１８に当たるのがバイエルンチケット、ジャパンレイルパスがジャーマンレイルパスと同じです。
よって、バイエルン州だけをゆっくり回る人以外にはバイエルンチケットは勧めません。

まあ、きっぷは枝葉末節なことで大事なのは旅程ですので、お好きにされるといいと思います。