クロアチア航空以外では

例えばルフトハンザで、当初の予定ルートだと、

11月2日(金) 08:50London, Heathrow 11:35 Frankfurt LH901 4時間10分 エコノミー (W)
11月2日(金) 12:20Frankfurt 14:00 Split LH6004 Croatia Airlines による運航です。 エコノミー (W)
11月9日(金) 12:40Ljubljana 13:40 Munich LH6913 Adria Airways による運航です。 4時間50分 エコノミー (W)
11月9日(金) 15:25Munich 16:30 London , Heathrow LH2478 エコノミー (W)

料金（1名様分） 税金・手数料・燃油追加料金（1名様分） 人数 　　　　　合計
129 　　　 + 　　223 　　　　　　　　　　　　　　x 1 名（大人） = £ 352

等のチケットもあります。

ルフトハンザだと、アドリア航空（ＪＰ）、クロアチア航空（ＯＵ）のほとんどの便はコードシェアしているので、選択肢は広いと思います。

ルートとしては、
リュブリャーナｉｎ　→陸路→　ザグレブ　→陸路または空路→　スプリット
→陸路→　ドブロヴニク　→陸路→　サラエボｏｕｔ
の一方通行が良いかと思います。

なお、ザグレブからスプリットの国内線は、クロアチア航空で片道でも安く買えます。

クロアチアの観光地ですが、もし空路でスプリットに入ったら、空港から２Ｋｍのトロギールをお勧めします。
スプリット自体は、宮殿内だけが見どころで、街の雰囲気を楽しむには少し不足です。
その点トロギールの方がコンパクトに街がまとまっていて、散策が楽しいかと思います。
もっとも、ドブロヴニクに十分時間を取れればいずれの街も劣りますが。

私のプロフィール画面から、旅スケ一覧を見て頂くと、今年を含む複数のクロアチア旅行記がありますので、よろしければ観光地の情報収集にご覧下さい。