移動は簡単

ポルトガルはリスボンを除くと半日程度で観光できる街、観光地が無数にある国です。
全部で何日あるのかわかりませんので、６ヶ所しかお勧めしませんでしたが、リスボン２日程度+移動を含め１ヶ所１日とみればOKかと。
６ヶ所で１週間あればいいのでは。

北海道+四国程度の大きさですので、移動は簡単です。

バス網が発達していて、本数も多いです。
都市間は列車のほうが本数はバスより少ないものの、速いかと。

列車乗り放題のユーレイル・ポルトガルパスもあります。
６ヶ所のうち、ナザレ、サンヴィセンテ岬は最寄駅からバスになりますが、他は列車で行けます。
コインブラ、ポルトも含めて。