調べてみました

深入りしないつもりだったのですが、、、

あくまで参考に
スカイチームのパスでアテネまで
飛んで、
AZ720 FCO 0855 ATH 1200
AZ718 FCO 1330 ATH 1635
AZ722 FCO 2120 ATH 0025*
恐らく、USD170

OK421 ATH 0550 PRG 0740
OK423 ATH 1605 PRG 1755
恐らく、USD120

距離的には近いが鉄道の便が悪く、列車で7-12 hr掛
かるのが、
OK772 PRG 1235 KRK 1355
OK770 PRG 2055 KRK 221
往復して、USD60x2(だと思う)

プラハ-ザルツブルクが6.0-9.5 hr
ザルツブルク-ミュンヘンが1.5-2.0 hr

さらに北上し、ローマへの道を南下してスイスへ。
ミュンヘン-チューリッヒが5.0-6.0 hr
ルガーノ-ミラノが1.0-1.5 hr

ミラノとバルセロナとの往復は、
USD90x2ですが、AZの往復の安い料金が1諸経費込みで
60ユーロなので、ほぼ同じでしょう。しかし、パスの
ほうは日程変更等の柔軟性があるので、価値が高いの
は確かです。

AZ50 MXP 0940 BCN 1115
AZ52 MXP 1535 BCN 1710
AZ56 MXP 2100 BCN 2235

概算すると約US600で、これに特別燃料費等が加算され
ます。

プラハからフランクフルトに飛び、ローマへの道を南下
し、ザルツブルクまで。さらにスイスに行き、ミラノに
出る。ミラノからバルセロナに飛び、バルセロナからロ
ーマに戻る。

OK534 PRG 0720 FRA 0835
OK536 PRG 1710 FRA 1820
これは
USD90です。BCN-FCOは500マイルを越えるので、USD120と
なるため、合計約USD700
これなら、かなり楽になると思われます。

私は鉄道は6時間程度が限界なので(本も読めないから飽き
る)長い距離は空路を使いますが、鉄道好きなら苦もなく
こなせるでしょう。

しかし、マルコポーロ3さんが指摘されているように、航空
機利用に慣れて居ない人がいきなり、これだけのフライトを
こなすというのも、トラブルの元になるかも知れません。
時間は掛かるが、自由度はとてもあるのが鉄道ですし、長い
歴史もあります。南米でペルー高地やボリビアに行くのに、
飛行機で一気に行けば、大抵の人は高山病で倒れるが、低地
から遠路はるばる鉄道で来た人はぴんぴんしているのと同じ
で、いきなり環境の変化を受けるのは健康上も良くないかも
知れません。スイスからイタリアに抜けるのだって、車掌の
言葉がスイスドイツ語から、イタリア語に変わって行くさま
は味があるし、同じ国でもイベリア半島などは、アンダルシ
アに近づくにつれ、マドリードを出たときは寡黙だった若者
たちが、ギターを抱え皆で歌い出す光景などは列車でしか味
わえません。

まあ、悩んで見てください。