北インドの旅程について

はじめまして。経験乏しいですが、インド在住なので参考までに記載いたします。
まず、現在の北インドは冬の時期であり、通常時にくらべ気温が低く霧も発生しやすいです。毎年11月-2月の大気汚染とあいまって、街中はもやがかかったような日が多く、霧なのか大気汚染なのか区別がつかないので一応マスクされることを推奨します。

日本人で、アグラからバラナシまで電車で行くというのは私は聞いたことがなく電車移動がどうなるのかは正直わかりません。ただ、デリー⇔アグラ間でも電車は遅延が発生しますので、結構時間がかかることを覚悟すべきだと思います。
私だったら一旦デリーに戻ってデリーで一泊してから、翌日飛行機でバラナシまで移動します。バラナシは、Theインドですので、体調を崩さないようお気をつけください。そしてバラナシで観たいところが多々あれば良いのですが、一人で2泊だと少し時間をもてあますのではと個人的には思います。バラナシでやることを事前に良くリサーチされると良いかもしれません。

インドはホテル代が基本安いですので、思ってるより低価格で5つ星ホテルにも泊まれます。行かれる場所はどこも人気の観光地で選択肢が多いので、立地と予算を考慮して、口コミがよさげなところを選定していただくのが良いかと思います。具体的なアドバイスではなくすいません、、、

あと、デリーにも観光スポットはありますし、ショッピングやアーユルヴェーダマッサージなども選択肢に入れられるので、デリー観光も組み込んでよいかと思います。
上記、多少なり参考になれば幸いです。良い旅を！