ドキュメント類はあると思いますが...

お返事ありがとうございます。

はい、レンタル時に」いろいろな書類は受け取ると思いますし、そのひとつにダッシュボード内に、車検証（車両証明書）などはあるのかもしれません。
ただ、それらで、十分なのかが心配になりまして、国際フェリーのレンタカー利用などがある方のご意見を伺いたく思った次第です。

国境越え可については、Rentalcars.com からの回答で確認しましたが、その際に、フェリー乗船の事を合わせて聞かなかった（陸路とフェリーで違うという認識がなかった）ので、
改めて問い合わせてみます。

海外のサイトなどでもいろいろ事例を調べていますが、レンタカー会社や車によっていろいろであったり、Budgetでクロアチアへの越境はOKと契約書にあったのに、フェリーではだめだった....とかもあって...

クロアチアの北上については、確かに、駐車の苦労などあるかもしれません。 ただ、アドリア海をグルッと一周する形で旅行したいと考えた場合、BARIで乗り捨てて、フェリーで体だけ渡り、再度、クロアチアで借りて北上なり、バス等で北上というのも考えられなくはないのですが、総合的に、追加2万円ほどで、夜行でクロアチアへ行けて、便利さもあって... といろいろ考えてフェリーがいいかな...と思っているところです。