エジプト経由

というのをお勧めしようと思っていました。
アフリカは南方以外、残念ながらエボラだの、イスラム過激派だの、あまりいいユースがありません。
可能性としては、飛行機でエジプト入り。列車もしくは飛行機、船で南下。現状よくわかりませんが、スーダン入り可能です。スーダンでは列車で南下。ジュバへ、ケニアまで多分、有料ヒッチハイクでトラックなどに乗って陸路で可能です。ケニアまで行ければ、タンザニア、ウガンダは問題なしです。エチオピアにはどこから入るか。私は、この情報は持っていません。タンザニアからブルンジ、ルワンアへの入国も可能。その後の陸路での南下は南アフリカまであまり問題ないはずです。
ケニアからは飛行機でどこにでも飛べますが、ツーリストに直接関係なくてもイスラム過激派のニュースで、治安は安定していませんね。
ビザの関係がありますから、国境で取れない場合がありますので、ビザの有効期限を考慮して、ナイロビで可能な限りのビザを取ったほうがよろしいですね。
ケニア、タンザニア、ボツワナ、ジンバウェ、ナミビア、は国境でビザ取得可能。ザンビアは事前に必要です。他の国は、調べてみてください。
ご成功をお祈りいたします。