お答えさせていただきます。

色々とご指南ありがとうございます。

入国管理事務所の事も聞いたんですが空港の入国管理事務所へ行ってくださいとのことでした。

仰る通りパスポートコピーはパタヤで最後に宿泊したホテルでお願いしてコピーしてもらいました。

ご存知か分かりませんが、タイは常夏の国で現地人ですら歩いてる人をあまり見かけません。
日本は只今寒いですが、現地は日中30度を超えてます。
その暑さの中、歩いて泊まれるかどうか分からない宿探しは体力の消耗が激しいです。
確実性を求めてパスポート提示がない漫画喫茶という選択にしました。

>渡航書申請の翌日以降の帰国便
私は現在のタイの日本大使館の事について語ってます。
諸外国の話は分かりかねます。
私は申請へ行く前に大使館へ電話して全て聞いてますので、これから紛失、盗難された方は先ず大使館へ電話して即日発行が可能かどうか聞くべきかと思います。
職員の方も仰ってましたが、正月明けで非常に混雑してる時で朝1番申請で受け取りが13時半ですから、平日はもっと早いのではないでしょうか。

後から思ったんですが、いち早く帰国を望んでいる方なら渡航書を受け取る時間がはっきり分かった時点で航空券の手配すれば当日帰国出来ると思います。